Cuatro usos de la Morfometría Geométrica

Lawing & Polly (J of Zoology , 2009) acaban de publicar un breve pero muy completo review acerca de cómo están organizado los métodos en Morfometría Geométrica (MG) , cómo funcionan y en cada caso cuales son sus limitaciones. Además revisan 4 aplicaciones de esta herramienta: Filogeografía con datos de MG, asimetría como una medida de heterogeneidad ambiental o neutralidad en los caracteres, morfogénesis y deformación morfológica en fósiles. Si alguien desea un PDF del artículo puede escribirme a esta dirección david.martinez@posgrado.inecol.edu.mx
Saludos

Anunciando "ResearchBlogging" en Español

Cada vez hay mas divulgación de la investigación científica en internet, frecuentemente acompañada de opiniones o discusiones sobre su trascendencia, impacto o controversias. Ademas de los sitios web de noticias asociados a las casas editoras o las revistas científicas, los blogs se han convertido en un medio muy prolífico. No obstante, la libre publicación de discusiones sobre la ciencia en los blogs permite mucha heterogeneidad en cuanto a la seriedad y calidad académica de los contenidos.
El problema ahora es identificar las colaboraciones de calidad académica.

• son opiniones serias, documentadas y escritas por conocedores del tema de investigación?
• son opiniones o revisiones basadas en investigación publicada en revistas arbitradas?

El sitio web ResearchBlogging.org ha ayudado a la gente a encontrar y compartir entradas académicas acerca de investigación arbitrada, en lugar de sólo reportes noticiosos y comunicados de prensa. El autor publica en cualquier blog una opinión de su lectura de un articulo de investigación publicado en una revista arbitrada. El autor identifica esa colaboración en su blog como una opinión académica insertando el icono de ResearchBlogging.org. Las entradas publicadas en varios blogs e identificadas como académicas son agregadas a una base de datos y mostradas en un sitio central para enterase fácilmente de ellas.

Desde 2007 se ha ofrecido este servicio de identificación y agregación de entradas en blogs escritos en Ingles y Alemán. A partir de hoy también podremos ver las entradas de calidad publicadas en diversos blogs en Español, sobre la investigación arbitrada.

Se invita a que se registren blogs en Español. Si tu publicas entradas en español (o inglés o alemán) acerca de investigación arbitrada, visita nuestra página de registro para darte de alta y formar parte de la comunidad de ResearchBlogging.org. Para más información en Español visita Spanish.ResearchBloggingLanguages.org.

Invitación a los colaboradores de "Morfometría Geométrica

Nuestro blog ya esta admitido en ResearchBlogging.org. Si colabora en el blog de "Morfometría Geométrica", quiere escribir opiniones sobre artículos publicados en revistas arbitradas y desea que sus discusiones sean ahora identificadas por su calidad académica, entonces solicite su ingreso como usuario en ResearchBlogging.org. Puede encontrar ayuda sobre como registrarse aqui.

Ingrese a la pagina: http://www.researchblogging.org/account/createChooseBlog y seleccione la opción 2: "Request to be added as an additional user to a blog that someone has already registered", seleccione el blog "Morfometría Geométrica" y provea su nombre.

Comparta sus opiniones sobre los artículos que lee y ayude en el esfuerzo de divulgación del conocimiento científico (ver Lineamientos).

Que son los Analisis de Componentes Principales "Evolutivos"?

Confieso mi ingenuidad e ignorancia: me ha sorprendido leer que existen "Análisis de Componentes Principales Evolutivos"!
La fuente de la iluminación es el articulo:
Jesse M Meik & Andre Pires-daSilva. 2009. Evolutionary morphology of the rattlesnake style. BMC Evolutionary Biology 9:35 doi:10.1186/1471-2148-9-35
Article URL http://www.biomedcentral.com/1471-2148/9/35

Así que me dispuse a leerlo y averiguar que es este método, pues solo con el nombre me inspira una predisposición psicológica muy favorable.

Los datos: 8 medidas de los cascabeles de serpientes (el estilo), cuatro medidas de otras partes del cuerpo y el numero de escamas subcaudales. Nada extraordinario: distancias entre marcas y conteos.
Los ajustes: todas las variables transformadas en logs base 10. Se calcularon los residuales de la regresión de las variables contra una de ellas (snout–vent length) como una manera de estandarizar el efecto del tamaño.
La referencia: una filogenia ad hoc para colocar 34 especies en cinco grupos.
Los análisis ACPE: un circo extraordinario de tres pistas y necesito que alguien me dirija para disfrutar el espectáculo.
No quiero arriesgarme a hacer una mala traducción o una mala interpretación. La explicación de los autores dice:

"In cross-species comparisons, EPCA has an advantage over standard PCA in that EPCA extracts axes that maximize evolutionary change rather than ordinating static variation. In this variant of PCA, ancestral states are first reconstructed using squared-change parsimony and then eigenanalysis is performed on vectors of evolutionary change along each branch [18]. Thus, by incorporating phylogenetic information, EPCA is potentially able to reduce non-independence of cross-species data sets due to similarity through common descent."

El software: Dyreson E, Maddison WP. 2006. Rhetenor package for morphometrics. 1.11 edition: Mesquite module.
Los resultados: Se graficaron los dos primeros componentes y se identificaron las variables correlacionadas con estos, como es usual.

Las interpretaciones:

"Thus we interpret the main spectrum of interspecific differences in style shape to reflect a continuum from relatively longer styles with deeper prongs, wider gaps between prongs (i.e., greater angle), more attenuated prongs, and greater constriction (or notching) near the juncture with the prongs and the anterior body of the style, to relatively shorter styles with shallow, but broad, prongs (or, in the extreme condition, prongs absent), and less constriction at the juncture of the prongs and the anterior
style body (see Fig. 1)."

Seguro que alguien ya había oído de este método! Que opinan? Realmente es la manera de revelar la información de las diferencias evolutivas entre linajes? Que otras alternativas existen?

Mi preferencia es tradicional: reconstruir la serie transformacional optimizando los cambios de estados en el cladograma. El diagnostico de los estados por supuesto puede ser referido a un espacio morfometrico. Mi preferencia es el morfoespacio mediante los Análisis de Variables Canonicas extraido del espacio configurado por las variables que describen la característica estudiada.

Espero sus comentarios y aclaraciones, pues seguro se me escapa algo sobre los ACPE.

Meik, J., & Pires-daSilva, A. (2009). Evolutionary morphology of the rattlesnake style BMC Evolutionary Biology, 9 (1) DOI: 10.1186/1471-2148-9-35