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5 de diciembre de 2016

Curso de Morfometria Geometrica en el IIA, UNAM. 2017

Con la organización a cargo de la Dra, Abigail Meza, se han iniciado los planes para programar un curso de Morfometria Geometrica en el Instituto de Investigaciones Antropológicas, UNAM. Ciudad de México.

Será la edición 2017 de este curso intensivo de una semana de Lunes a Viernes, pero todavía no hay fecha definida. 

Los profesores serán E De Luna, Marcia Ramirez y Sandra Ospina.

Los interesados pueden escribir a la organizadora para establecer contacto.
Dra . Abigail Meza Peñaloza, email
Investigadora Titular A, TC‚ Pride:B.
IIA, UNAM, Ciudad Universitaria. CDMX
website
http://www.iia.unam.mx/investigacion/semblanzas.php?nom=Abigail&ape=Meza%20Peñaloza


Este curso de MG se ha ofrecido anualmente con el aval de varios posgrados, los tres últimos cursos han sido en los posgrados del INECOL-Xalapa, el CIB- UAEH de Pachuca y Ciencias biologicas de la UAT en Tlaxcala.  La información general y el temario esta en el sitio web permanente de este curso: http://www.filogenetica.org/cursos/Morfometria/

Los avisos sobre la fecha de la Edición 2017 de este curso y la convocatoria para recibir solicitudes estarán disponibles en el sitio web permanente del curso.

Saludos
Efrain

1 de diciembre de 2016

Curso Introduction to Geometric Morphometrics, 29 de Mayo - 2 de Junio de 2017, Barcelona

Ya está la abierta la matrícula para la novena edición del curso "INTRODUCTION TO GEOMETRIC MORPHOMETRICS".

Profesores: Prof. Chris Klingenberg (University of Manchester, Reino Unido) y Dr. Jesús Marugán (UAM, España).

Fechas: 29 de Mayo al 2 de Junio de 2017.


El curso se imparte en inglés (max. 25 plazas).

Programa:
1. Introducción: Forma, tamaño y morfología biológica.
2. Datos morfométricos: landmarks, contornos y superficies.
3. Visualización de formas y cambio morfológico.
4. Evaluando la variación: ACP.
5. Distinguiendo grupos: ACV y análisis discriminante.
6. Simetría y asimetría.
7. Morphometría en un mundo desordenado: valores atípicos y medición del error.
8. Regresión y alometría.
9. Covariación: PLS.
10. Integración morfológica.
11. Modularidad.
12. Filogenia y métodos comparativos.
13. Combinación de análisis para resolver cuestiones biológicas.
14. Presentación de los trabajos de grupo por los participantes.



22 de noviembre de 2016

Curso Intensivo: Morfometría geométrica y su aplicación en el estudio de las formas biológicas


Organiza: Centro de Investigación en Biodiversidad y Conservación (CIByC) de la Universidad Autónoma del Estado de Morelos (UAEM).

Del 30 de Enero al 10 de Febrero de 2017.  Cuernavaca, Morelos.

Imparte: Dra. Sandra M. Ospina.
Ponentes invitados: Dr. Efraín de Luna, Dr. José A. Guerrero, Dra. Marcia Ramírez.

Presentación: Este curso esta dirigido principalmente a estudiantes de posgrado pero pueden aplicar estudiantes de licenciatura, profesores e investigadores, interesados en aplicar la Morfometría Geométrica como herramienta de estudio de la forma y que cuenten con los conocimientos previos requeridos. El curso contendrá tanto elementos teóricos (teoría matemática, conceptos estadísticos y métodos de análisis multivariado) como prácticos para el análisis de datos morfométricos en programas especializados (serie Tps, serie IMP, librerías Geomorph, Shapes y Morph del programa R).

Requisitos: Los interesados deberán estar familiarizados con los métodos morfométricos tradicionales, análisis de varianza, regresión y los métodos estadísticos multivariados.

Duración: 80 horas

Inscripción: Universidad Autónoma del Estado de Morelos, a través del Centro de Investigación en Biodiversidad y Conservación. Costo para estudiantes externos $1500. Llenar el cuestionario de preinscripción anexo y enviarlo a los organizadores: Dra. Sandra M. Ospina: ospinagarcess@gmail.com, Dr. Víctor Toledo: victor.toledo@uaem.mx


Cuestionario de preinscripción al curso.

1. Tiene alguna experiencia con análisis morfométricos en general? Descríbala brevemente.

2. ¿Cuál es la pregunta de investigación que desea contestar mediante esta herramienta?

3. ¿Cuál es el campo de investigación de su interés?  Resuma en un párrafo su trabajo de investigación.


4. Describa brevemente su experiencia estadística (Análisis más usados).

Los nombres de los estudiantes aceptados se publicarán continuamente por este medio hasta el 23 de Enero.

Formato: El programa contempla una sesión teórica de 4 horas en la mañana y una práctica de 4 horas en la tarde, de Lunes a Viernes (una hora y media de comida). Las clases se impartirán entre las 9 am a las 5 pm.

Objetivos:  Dar instrucción teórica y práctica en los métodos para el registro de
datos morfométricos (coordenadas de marcas) y el análisis estadístico de los mismos. Explorar las aplicaciones de la Morfometría Geométrica en diferentes líneas de investigación.

Contenido:
1. Introducción. Concepto de forma. Morfometría Tradicional y Morfometría Geométrica. Métodos de Registro: Marcas y semimarcas.
2. Conceptos de Geometría. Vectores. Espacios geométricos de la forma. Métodos de superposición.
3. Proyección de configuraciones. Espacios tangentes. TPS generalizado.
Coordenadas Procrustes. Warps.
4. Análisis estadísticos.
Modelos lineales. Varianza (ANOVA y MANOVA), covarianza, regresión.
5. Métodos de ordenación. Análisis de componente principales. Análisis canónico de variables.
6. Aplicaciones. Asimetría, Ontogenia, Filogenia, Método comparativo.





24 de octubre de 2016

Course GM in R, Jan 23-27, Barcelona: early bird extended

Dear colleagues,

Early bird registration has been extended to November 30th for the course "Geometrics Morphometrics in R".

Dates: January 23th-27th, 2017.

Instructor: Dr. Julien Claude (Institut des Sciences de l'Évolution de Montpellier, France), author of Morphometrics with R (http://www.springer.com/us/book/9780387777894). 

PLACE:  Facilities of the Centre de Restauració i Interpretació Paleontologica, Els Hostalets de Pierola, Barcelona (Spain). 


PROGRAM: 
Monday, January 23rd, 2017.
1. An Introduction to R / Image Processing / Organizing Morphometric Data.
1.1. Some Basics in R.
1.1.1. The R Environment.
1.1.2. R objects, Assigning, Indexing.
1.1.3. Generating Data in R.
1.1.4. 2D and 3D Plots in R; Interacting with the Graphs.
1.2. Organizing Data for Morphometrics.
1.2.1. Data-frame, Array and List.
1.2.2. Converting and Coercing Objects.
1.2.3. Read and Write Morphometric Data in R.
1.3. Image Processing in R.
1.3.1. Reading Various Image Files.
1.3.2. Obtaining Image Properties.
1.3.3. Modifying Image Properties: Contrast, Channels, Saturation Directly from R or by Interfacing R with Imagemagick.
1.4. Simple Tests, Simple Linear Modelling, Alternatives to Linear Modelling, an example using traditional morphometrics.
1.4.1. Defining size and shape using PCA and log-shape ratio approaches.
1.4.2. Getting stats and test outputs.
1.4.3. Testing assumptions of linear modelling.
1.4.4. Testing for allometry and isometry.
1.4.5. Solutions when assumptions of linear modelling are not met.

Tuesday, January 24th, 2017.
2. Landmark data.
2.1. Acquiring Landmark Data in R.
2.2. Plotting Landmark Configurations in 2 and in 3D.
2.2.1. Using Different Symbols and Setting the Graphical Parameters.
2.2.2. Labeling Landmarks.
2.3. Geometric Transformation with Landmark Configurations.
2.3.1. Translation.
2.3.2. Scaling using Baseline or Centroid Size.
2.3.3. Rotation.
2.4. Superimposing and Comparing Two Shapes.
2.4.1. Baseline Superimposition.
2.4.2. Ordinary Least Squares Superimposition.
2.4.3. Resistant Fit.
2.5. Representing Shape Differences.
2.5.1. Plotting Superimposed Shape with Wireframe.
2.5.2. Lollipop Diagrams and Vector Fields.
2.5.3. Thin Plate Splines and Warped Shapes.
2.6. Superimposing More Than Two Shapes.
2.6.1. Baseline Registration.
2.6.2. Full Generalized Procrustes Analysis.
2.6.3. Partial Generalized Procrustes Analysis.
2.6.4. Dimensionality of Superimposed Coordinates.

Wednesday, January 25th, 2017.
2.7. Exploring Shape Variation and Testing Hypotheses.
2.7.1. PCA.
2.7.2. Multivariate Linear Modelling (Multivariate Regression and MANOVA).
2.7.3. Allometry free approaches (Burnaby correction).
2.7.4. Linear discriminant and Canonical Analysis.
3. Outlines.
3.1. Acquiring outline Data in R.
3.2. Fourier Analysis.
3.2.1. Principles.
3.2.2. Fourier Analysis of the Tangent Angle.
3.2.3. Radius Fourier Analysis.
3.2.4. Elliptic Fourier Analysis.
3.2.5. Reduction of Shape Variables.
3.2.6. Statistical Analysis of Shape Variation with Fourier Analysis.
3.2.6.1. Exploring Shape Variation and Testing Hypotheses.
3.2.6.2. PCA.
3.2.6.3. Multivariate Linear Modelling (Multivariate Regression and MANOVA).
3.2.6.4. Canonical Analysis.

Thursday, January 26th, 2017.
3.3. Combining Landmarks and Curves.
3.3.1. Hybrid Methods between Fourier and Procrustes Analysis.
3.3.2. Sliding Semi Landmarks.
3.4. Solutions for Open Curves.
4. Specific Applications.
4.1. Testing Measurement Error.
4.2. Partitional Clustering.
4.2.1. K-means, Partition Around Medoids.
4.2.2. Mclust.
4.2.3. Combining Genetic, Geographic and Morphometric Data.

Friday, January 27th, 2017.
4.3. Modularity / Integration Studies.
4.3.1. Two-block Partial Least Squares.
4.3.2. Testing Among Various Sets of Modules.
4.4. Fluctuating Asymmetry and Directional Asymmetry.
4.4.1. Inter-Individual and Intra-Individual Variation.
4.4.2. Object and Matching Symmetry.
4.5. Bending Energy, Uniform and Non-uniform Shape Variation.

This course is organized by Transmitting Science, the Institut Català de Paleontologia and the Centre de Restauració i Interpretació Paleontologica.

7 de octubre de 2016

Cual programa de morfometria es mas usado? Encuesta


http://www.easypolls.net/poll.html?p=57f7fe37e4b03d77a3f49746

Agradeceré su participación en esta encuesta en linea. En algun tiempo razonable, posiblemente un mes, publicaré aqui los resultados.
Como ven?
Por favor visiten el siguiente sitio web para participar. Gracias

http://www.easypolls.net/poll.html?p=57f7fe37e4b03d77a3f49746

Asi es como va ahora (0ct 12):

Asi es como va ahora (0ct 20):

A un mes: el resultado es final? (Nov 7):

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