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8 de julio de 2009

Proyecto de la morfometria del subgénero Megaluracarus Viets, (Acari: Hydracarina: Arrenuridae: Arrenurus)


Los ácaros dulceacuícolas o hidracáridos constituyen el grupo de quelicerados acuáticos más diverso, su riqueza se explica en parte por la coevolución con diferentes grupos de insectos acuáticos a los que parasitan y/o depredan, así como por la capacidad de dispersión que éstos les confieren (Smith et al., 2001).
El género Arrenurus Dugès (Hydrachnidia: Arrenuridae) es el grupo más grande de ácaros dulceacuícolas con alrededor de mil especies descritas (Cook et al., 1989); su evolución ha dado como resultado varios grados de dimorfismo sexual, con base en lo cual se ha dividido en nueve subgéneros. Entre éstos, Megaluracarus, ya que está constituido por alrededor de 260 especies, de las cuáles 190 se distribuyen en América (Rosso de Ferradás y Hernández, 2005; Cook, 1980; Cramer y Cook, 1992). En México, se han registrado 18 especies de dicho subgénero (Cook, 1980; Cramer y Cook, 1992; Rivas y Cramer, 1998), varias de ellas cohabitando en el mismo cuerpo de agua, en estos casos, se ha observado que las diferencias morfológicas entre los machos de algunas especies son casi graduales (obs. pers.).
En este sentido, los análisis morfométricos son una herramienta muy útil ya que permiten detectar diferencias sutiles entre las especies. Dichas distinciones suelen ser factibles de interpretar biológicamente, lo cual puede incrementar la precisión y resolución de posteriores análisis filogenéticos y faunísticos a gran escala (Budd et al., 1994; Cazorla y Acosta, 2003; Grobler et al., 2006; Reuschel y Shubart, 2006).
Este proyecto constituye el primer análisis morfométrico de la forma del cuerpo en un grupo de ácaros dulceacuícolas. Se espera que los resultados permitan elaborar hipótesis sobre distintos aspectos de su biología, como su diversidad y su distribución. Se ha revisado la bibliografía referente a la descripción de las especies del género Arrenurus. Preliminarmente, se han encontrado 260 especies del subgénero Megaluracarus descritas a nivel mundial, de las cuales 191 se han descrito para el continente americano. Para 96 de éstas especies, se ha obtenido la imagen digitalizada de la vista dorsal del cuerpo de los machos, escaneada a partir de las descripciones originales (Fig. 1). Las principales diferencias en la forma del cuerpo o idiosoma de los machos de Megaluracarus, se observan en la parte posterior o cauda: puede ser corta o larga, redonda o angulosa, o presentar protuberancias; la parte anterior del cuerpo a veces puede presentar proyecciones semejantes a cuernos o bien ser redondeada.

Fig 1. a Vista dorsal, y b) vista lateral del macho de Arrenurus (Megaluracarus) colitus,
la flecha señala la cauda.

La idea básica de realizar esta exploración de la forma, es confirmar, si como se ha observado a simple vista, existen especies que comparten una forma básica, es decir, si se conforman grupos de formas; y por otra parte tratar de dilucidar si dichas formas reflejan algún tipo de patrón biológico (p. ej. a nivel biogeográfico, ecológico o evolutivo).

Según la forma de la parte anterior del idiosoma y el largo y forma de la cauda, las 96 especies se repartieron en seis diferentes grupos. La primera parte de este proyecto consiste en hacer un análisis morfométrico prospectivo de cuatro grupos de especies.

Una dificultad a resolver es que el contorno corporal en vista dorsal no presenta marcas que puedan considerarse homólogas, por lo que se esta experimentando con la definicion de seudomarcas (Fig. 2) utilizando MakeFan (Integrated Morphometric Package, IMP). Se digitalizaron las coordenadas "x,y" de 44 seudomarcas con TPSDig. Las configuraciones de seudomarcas de cada especie fueron alineadas con la superimposición Procustes (PS) en CoordGen (IMP). Las semimarcas deben ser alineadas a lo largo de sus curvas parciales respectivas, para esto se utilizó Semiland6 (IMP). Para generar las variables de forma (Partial Warps) se utilizó la aproximación thin-plate spline (TPS).




Fig 2. Forma generalizada grupo 4 (azul) contra grupo 1 (rojo).
Fig 3. Forma generalizada grupo 4 (azul) contra grupo 2 (rojo).
Fig 4. Forma generalizada grupo 4 (azul) comparada con la forma generalizada del grupo 3 (rojo).


Los analisis multivariados consistieron en Analisis de Componentes Principales (PCA) y Analisis de Variables Canonicas (CVA). Para observar las tendencias generales en la variación de la forma del idiosoma en vista dorsal de Megaluracarus, los datos fueron analizados con PCAGen6 (IMP). Para discriminar entre sí a los cuatro grupos analizados, se utilizó CVAGen6 (IMP). Para evaluar la significancia de las diferencias en la forma por pares de grupos, se utilizó TwoGroup6 (IMP).

Fig 5. Gráfica de la Componente 1 contra la Componente 2.
Fig 6. Gráfica de la Componente 1 contra la Componente 3.


Fig 7. Deformación en la Componente 1.
Fig 8. Deformación en la Componente 2.


Considero que las pseudomarcas, en el caso de la forma de Megaluracarus, son una técnica bastante útil, ya que caracterizan bastante bien el contorno del cuerpo, y permiten cumplir con el objetivo central del trabajo que es hacer una primera exploración de la forma. Con respecto al número de marcas, parecen ser suficientes para caracterizar la forma, ya que se concentran principalmente en la parte posterior del cuerpo de los ácaros o cauda, que es la que varía con mayor frecuencia entre las especies.
Personalmente considero que la morfometría geométrica es un campo apasionante. El poder examinar a los organismos de esta manera, y no estar limitados a las simples mediciones, da la posibilidad de responder preguntas que antes serían inimaginables. A pesar de lo difícil que puede parecer la metodología a primera vista, al entenderla y aplicarla, se vuelve relativamente sencillo seguir cada paso y explicar y discutir los resultados. Tengo muchas expectativas de este trabajo y de las preguntas que sere capaz de resolver y sobre todo de las que surgiran sobre la marcha.

3 de julio de 2009

Libros de morfometria en Español?

Tengo registros bibliográficos de estos libros de morfometría en Español.

1) Apuntes básicos de morfometría

  • Autores: Luis Gállego Castejón
  • Editores: Universitat de les Illes Balears
  • Año de publicación: 2005
  • Edición: 1ª, 1ª Reimpresión
  • País: España
  • ISBN: 84-7632-928-8

2) Morfometria
  • Author: A González
  • Year: 1989
  • Publisher: Ediciones del Consejo Científico Veterinario-Cuba, 1989
  • Length: 24 pages

3) Principios de morfometría: Introducción a la cuantificación de la forma de muestras biológicas
  • Author: Juan de Dios Escolar Castellón
  • Year: 1997
  • Editor: Prensas Universitarias de Zaragoza
  • Publisher: Prensas Universitarias de Zaragoza, 1997
  • ISBN: 8477334749, 9788477334743
  • Length: 101 pages
Me gustaría conseguirlos sea en PDFs o comprarlos.
Alguien sabe si estan disponibles? Mis primeros intentos por localizarlos fueron sin éxito. Agradeceré cualquier ayuda.
Saludos!
E

30 de junio de 2009

Ayuda para proyecto de morfometria de primates

Hola a todos, soy una tesista peruana, estoy realizando mi investigacion sobre Morfometria geometrica en craneos de primates, quisiera saber si alguien me pudiera ayudar con eso, porque aqui los conocimientos de MG son muy pocos, quiero trabajar mi investigacion con el TPS, pero no si se sea el mas indicado, agradeceria muchisimo la ayuda,

Saludos para todos

Anahis Beltran

Analysis of Organismal Form, a Web-based course

Analysis of Organismal Form

An introduction to morphometrics, delivered as a Web-based course

9 November – 18 December 2009

Instructor: Chris Klingenberg

Dear morphometricians

I am pleased to announce this year's morphometrics course from the University of Manchester. This year's course will run in the six weeks from 9 November to 18 December 2009.

The course information can be found on the following we site:
http://www.flywings.org.uk/MorphoCourse

Course content:
  • * Data acquisition: the kinds of data and the equipment used to collect them.
  • * Definitions of size and shape
  • * Geometric methods to characterise shape from a configuration of landmark points (Procrustes superimposition)
  • * Statistics of variation, scatter plots, basic multivariate statistics
  • * Principal component analysis
  • * Measurement error and outliers
  • * Shape transformations and 'warping' -- the thin plate spline
  • * Analysis of outline shapes
  • * Distinguishing between groups (taxonomy, clinical diagnosis, etc.)
  • * Allometry and size correction
  • * Influence of external factors on shape (ecomorphology, dose-response studies)
  • * Symmetric forms and measurement of asymmetry.
  • * Morphometric inferences on developmental processes, morphological integration, modularity
  • * Genetics of shape: analyses of resemblance between relatives, QTL analyses.
  • * Phylogeny: reconstructing the evolution of shape
Practice examples:
As far as possible, practical exercises are provided to accompany the course content. These practice exercises consist of data sets and explanations on how to run the respective analyses using the MorphoJ software (http://www.flywings.org.uk/MorphoJ_page.htm). Participants who already have their own data are encouraged to use those and to discuss them as part of the course. I hope there will be a bit of a 'workshop' feel to the course unit.

Group work:
Participants will work in small groups to prepare web presentations of possible morphometric studies. This activity stimulates discussion and provides a broad overview of questions that can be addressed with morphometric methods.

The fee for the course is GBP 190.00 (I'm afraid it's gone up a bit from last year -- but the UK pound has dropped against most other currencies...).

All prospective participants need to pre-register for the course. The deadline for this is the *31 August 2009*.

For further details, see the course web page:
http://www.flywings.org.uk/MorphoCourse

Best wishes,
Chris

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Christian Peter Klingenberg
Faculty of Life Sciences
The University of Manchester
Michael Smith Building
Oxford Road
Manchester M13 9PT
United Kingdom

Telephone: +44 161 275 3899
Fax: +44 161 275 5082
Web: http://www.flywings.org.uk
Skype: chris_klingenberg
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Financiamiento disponible para asistente de investigacion

Dear morphometricians,

there is a possibility that a Marie Curie funded short-term fellowship will be available in the Functional Morphology and Evolution Unit of the Hull York Medical School (http://hyms.fme.googlepages.com/home).

The project will be for a maximum of nine months (and a minimum of three) and will focus on biogeographic variation in skull morphology in red colobus monkeys, or similar. It will be supervised by Andrea Cardini and Sarah Elton. The data are already collected, and we are looking for someone with experience of geometric morphometric and / or spatial data analysis.

As it is a Marie Curie Early Stage fellowship, prospective fellows must be in the early stages of their research career (i.e. should not have a PhD or equivalent). UK nationals are not eligible to apply. Nationals of all other countries are eligible provided they have spent fewer than 12 months in the UK in total. The Fellowship must be completed by the end of March 2010. The funding for this project is dependent on finding a suitable applicant, and then is subject to confirmation. However, Andrea or Sarah would love to hear from interested people!

With kindest regards

Sarah and Andrea


Dr Sarah Elton
Reader in Anatomy; Phase I SSC Coordinator
Hull York Medical School
Email: sarah.elton(AT)hyms(DOT)ac(DOT)uk
Web: http://hyms.fme.googlepages.com/drsarahelton2


Dr. Andrea Cardini
Lecturer in Animal Biology

Museo di Paleobiologia e dell'Orto Botanico, Universitá di Modena e Reggio Emilia

via Università 4, 41100, Modena, Italy
tel: 0039 059 2056532; fax: 0039 059 2056535
Honorary Fellow
Functional Morphology and Evolution Unit, Hull York Medical School
University of Hull, Cottingham Road, Hull, HU6 7RX, UK
University of York, Heslington, York YO10 5DD, UK

E-mail address: alcardini(AT)interfree(DOT)it, andrea(DOT)cardini(AT)unimore(DOT)it, andrea(DOT)cardini(AT)hyms(DOT)ac(DOT)uk

http://hyms.fme.googlepages.com/drandreacardini

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