Curso de formación en Morfometría Geométrica, COLOMBIA

Universidad de Antioquia, Fac. de Ciencias Exactas y Naturales.

Dentro de sus actividades de extensión, el Instituto de Biología ofrece al publico interesado el curso intensivo de formación en "Morfometría Geométrica" que se realizará entre el 6 y el 13 de diciembre de 2008. Organizan: Grupo Chagas y Centro de Extensión de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Mayor información en los teléfonos 057(4) 2195655 ( proexten@matematicas.udea.edu.coEsta dirección electrónica esta protegida contra spam bots. Necesita activar JavaScript para visualizarla , servicios@biologia.udea.edu.coEsta dirección electrónica esta protegida contra spam bots. Necesita activar JavaScript para visualizarla ). Ver más.

Programas para morfometría: IMP

Con esta nota espero iniciar un efecto dominó para invitar a todos que publiquen aquí sus descripciones de los programas que usan para morfometría. Permitanme iniciar esta serie con mi programa favorito:

Integrated Morphometrics Package (IMP).

IMP es un paquete de varios programas. Fundamentalmente se usa para generar coordenadas comunes mediante técnicas de superposición (CoordGen) y para ordenar los componentes de la deformación relativa (PCAGen, CVAGen). El paquete contiene varios programas y se pueden hacer varias operaciones, análisis estadísticos y despliegues gráficos de la variacion y las deformaciones relativas.

Tipicamente el registro de las coordenadas puede hacerse con tpsDig (parte de la serie de programas de J. Rohlf) y luego IMP: CoordGen lee el archivo con las coordenadas registradas y las transforma por medio de superposiciones a coordenadas Procrustes, por ejemplo. Estas coordenadas se usan para estimar los componentes de las deformaciones. Las variables derivadas del analisis de la deformacion se usan finalmente para los analisis estadisticos, por ejemplo, de ordenacion, y para la visualizacion del cambio relativo de las formas mediante la tecnica de TPS (con IMP:CVA Gen). Otros programas del paquete IMP permiten realizar varios analisis estadisticos como Regresiones, Alometria, etc.

IMP es para Windows. Su funcionalidad es completa con WinXP y versiones anteriores. Tambien funciona muy bien bajo Linux (hemos trabajado con Ubuntu y OpenSuse). Es posible que la version para Mac Os este disponible en el futuro.

El instalador y los manuales para la operación de los programas individuales de IMP se pueden bajar "gratis" desde el sitio web del Dr. David Sheets, aqui:

IMP software

Ayuda Morfometría

Primero quiero comentarles que me parece muy interesante su blog y como lo estan actualizando continuamente, quiero pedirles de favor si me pueden ayudar a encontrar bibliografia pdf, sobre morfometría lineal y con análisis de fourier.

El hecho es que tengo que preparar mi examen predoctoral "identificación de grupos poblacionales a través del análisis de forma" y quiero abordarlo con las herramientas relacionadas, pero tengo muy pocos trabajos con las técnicas que les comente anteriormente, y me seria de gran ayuda tener articulos con aplicaciones y libros que pudiese consultar sobre las ventajas y desventajas de cada una de las técnicas.

Actualmente, estoy haciendo el doctorado en ciencias marinas en CICIMAR-IPN, La Paz, BCS. y estoy trabajando con sierra del Pacífico. Utilizando la forma del otolito con M. Geométrica hemos identificado 4 stocks en el Pacífico Mexicano. Esto tiene como consecuencia que podemos hacer recomendaciones que la evaluación pesquera y las medidas de manejo de este recurso sean dirigidas según las caracteristicas de cada uno de los stocks, ya que en México no se conoce mucho del recurso y es donde se extrae el 75% de la captura del Pacífico oriental.

Bueno el comercial anterior era para enterarlos sobre lo que trabajo, espero me puedan ayudar, gracias y saludos. jsramirezp@ipn.mx

Morfometría Geométrica y Salud Pública

Las técnicas de morfometria geométrica son de reciente aplicación en el estudio de insectos de importancia medica, desde el punto de vista epidemiológico esta herramienta a sido empleada para estudiar variaciones intraespecíficas (poblaciones domesticas y peridomesticas, antes y post rociado) y detectar riesgo de transmisión de la enfermedad de Chagas debido al alto y/o bajo flujo genético y continua movilidad que presentan las poblaciones de los vectores.
Cuando existe poblaciones muy homogéneas dado el constante flujo de las poblaciones de insectos, se prevé reinfestaciones a los domicilios, provenientes de los ambientes peridoméstico y silvestre, ejemplos de ello/ T//. maculata/ Venezuela ( Soto Vivas et al 2008);/ R. prolixus/ Venezuela (Matin et al 2007); /P. geniculatus/ Colombia (Jaramillo /et al./ 2002), /Triatoma dimidiata/ de México y el Norte de Guatemala (Lehmann /et al./ 2005), de igual manera se utilizado en discriminación taxonómica de /R. robustus/ en Bolivia (Matias /et al./ 2001), /R. prolixus/ y /R. robustus/ de Venezuela (Villegas 2002).
En triatominos marcadores tales como las dimensiones externas (morfometría), están muy influenciados por el medio ambiente, ejemplo de ello la presión de selección a través de insecticidas químicos y/o modificaciones del entorno,etc., durante el desarrollo del insecto del huevo al adulto. No obstante si se puede separar la variabilidad métrica en sus componentes ambientales y genéticos, la morfometria puede ser informativa e incluso ser convalidada con los resultados obtenidos con técnicas moleculares.

Informacion de mi proyecto reciente aqui >>>