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29 de febrero de 2008

Literatura reciente, 3

Cranial bone morphometric study among mouse strains

Minoru Kawakami and Ken-ichi Yamamura

BMC Evolutionary Biology 2008, 8:73doi:10.1186/1471-2148-8-73

Background

Little is known about the molecular mechanism which regulates how the whole cranium is shaped. Mouse models currently available for genetic research include several hundreds of unique inbred strains and genetically engineered mutants. By cross comparing their genomic structures, we can elucidate the cause of any differences in the phenotype between two strains. The craniometry of subspecies, or closely related species, of mice provide a good systemic model to study the relationship between genetic variance and cranial shape evolution. The lack of a quantified framework for comparing and analyzing mouse cranial shape has been a problem. For this reason, we performed quantitative analysis of cranial shape morphology between several mouse strains.

Results

This article reports on a craniometric assay of seven mouse strains: four inbred strains (C57BL/6J, BALB/cA, C3H/HeJ, and CBA/JNCr) from Mus musculus domesticus (M. m. domesticus); one closed colony strain (ICR) from M. m. domesticus; one inbred strain (MSM/Ms) from Mus musculus molossinus; and, Mus spretus as a strain from a species other than M. m. domesticus. We performed linear measurements and geometric morphometrics. Geometric morphometrics revealed that the cranial characteristics of each strains were clearly distinguishable. We obtained mean scores for each species using the tpsRelw Program and plotted them.

Conclusion

Geometric morphometrics proved to be useful for identifying and classifying variations in form, and it revealed that M. spretus has a slender cranium when compared with our other strains. The mean cranial shape of C3H or CBA was more similar to MSM/Ms, which is derived from M. m. molossinus, than to either C57BL/6J, BALB, or ICR which are derived from M. m. domesticus. Future work in this field will aid in elucidating the mechanism of whole cranial shape regulation.

2 de febrero de 2008

Concluyó el curso de Morfometría en la UAM Mex DF

Esta semana se realizó con éxito el curso de Morfometría Geométrica anunciado en la UAM Iztapalapa, Mexico DF.


El Lunes 28 de Enero por la mañana, el Dr. Francisco F. Pedroche, Director de la DCBS inauguró el curso. Nos acompaño también el Dr. Miguel A. Armella, Jefe del Depto de Biología. Las sesiones transcurrieron en un salón muy cómodo con hileras de mesas para trabajar en las computadoras.


Los 30 participantes contribuyeron muy entusiastas al buen desarrollo del curso. Al terminar cada sesión matutina nos daban sus opiniones y sugerencias. Por ejemplo, Leonardo Alvarado, uno de los participantes, comento: "La caricatura de lo que sucede en los diferentes espacios me pareció muy buena y clara, lo que me permitió entender mejor lo que los articulos explican. Las utilidades y restricciones en los cuales se aplican los ACP y los AVC complementaron mucho mejor el conocimiento que previamente habia recibido".
Por su parte, Montserrat Jiménez otra participante nos dijo: "En cuanto a dimensiones, transformaciones, etc fue muy interesante ver como funcionan los programas IMP y ver realmente que es lo que esta sucediendo al hacer el análisis en vez de solo puchar botones y no saber ni interpretar, asi como todas las decisiones que hay que tomar." Por otro lado, Noé González nos sugirió: "Me gustaría aprender mas de métodos, quizá no tanto su fundamento, mas bien sus aplicaciones."
Hubo de todo pero el comentario de Ma. Esther Meave nos halaga mucho: "Me ha gustado mucho la clase y he aprendido bastante".

El Jueves por la noche cenamos como grupo en un restaurant en Plaza Tezontle, cerca de la UAM. Despues de recibir nuestras constancias de participación, el curso fue formalmente clausurado por la Dra. Alondra Castro el viernes por la tarde.


Estamos muy agradecidos con los participantes por su dedicación y esfuerzo durante esta semana intensiva. Apreciamos el duro trabajo de Alondra en todos los arreglos locales de hospedaje y el salon para el curso. Gracias también al Dr. Pedroche por su apoyo y las facilidades puestas a nuestra disposición.
Invitamos a los participantes del curso a compartir sus opiniones, sugerencias y comentarios finales aquí.
Muchas gracias.

1 de febrero de 2008

Libro: Princípios de Morfometria Geométrica


Hola, creo que algunos de ustedes no deben conocerlo. El libro trata de historico, conceptos, teoría matemática, análisis estadísticas, thin plate splines y un artículo como ejemplo de morfometría geométrica. La lectura es muy clara y de fácil comprensión.


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